Tumorok epigenetikai ujjlenyomatait azonosítják

„Több százezer epigenetikai módosulás működik be- és kikapcsoló faktorként az egyes génszakaszoknál. Mintáik egyedi, összetéveszthetetlen ujjlenyomatot alkotnak.”

A Nature Cancer folyóiratban jelent meg a Charité-Universitätsmedizin Berlin kutatóinak cikke, amelyben olyan mesterséges intelligencia alapú modellek kifejlesztéséről számoltak be, amelyek az epigenetikai jellemzők alapján képesek több mint 170 féle tumor igen megbízható osztályozására, differenciáldiagnózisára. Ha például egy MRI felvétel egy igen kedvezőtlen helyen elhelyezkedő agydaganatot mutat, a biopszia nagy kockázattal járna egy olyan beteg számára, aki kettős látás miatt fordult orvoshoz. Pontosan az ilyen helyzetek késztették arra a Charité-Universitätsmedizin Berlin kutatóit, hogy új diagnosztikai eljárásokat keressenek, amelyekben mesterséges intelligenciát alkalmaztak.

“Célunk egy olyan modell kidolgozása volt, amely pontosan osztályozza a tumorokat, még akkor is, ha az adatok csak a teljes tumor epigenom egy részét képezik le, vagy ha ezeket az epigenetikai profilokat különböző technikákkal és változó pontossággal gyűjtötték” – fejtette ki Dr. Sören Lukassen, a cikk társszerzője.

Az újonnan kifejlesztett AI-modell neve crossNN, amelynek architektúrája egy egyszerű neurális hálózaton alapul. A modellt nagyszámú referenciatumorral tanították be, majd több mint 5000 tumornál tesztelték.

“Modellünk az összes eset 99,1%-ában lehetővé teszi az agytumorok nagyon pontos diagnosztizálását, és pontosabb, mint a jelenleg működő AI-megoldások” – ismertette az eredményeket dr. Philipp Euskirchen, a tanulmány első szerzője. “Ezenkívül ugyanilyen módon sikerült kiképezni egy olyan AI modellt is, amely képes megkülönböztetni több mint 170 daganattípust (minden szervből), 97,8%-os pontossággal. Ez azt jelenti, hogy a viszonylag ritka agydaganatok mellett minden szerv rákos megbetegedéseinek diagnosztizálására is alkalmazható az algoritmus.”

A teljes információ a publikációról beszámoló Medical Online oldalán olvasható.